影、ふたたび！伊賀の服部半蔵の血を受け継いだ柘植新八（千葉真一）をはじめとする【影の軍団】は、悪政による弊害から人々を守るために、今、“光”となる。お前だけには、忍者の世界を知らせたくなかったのに……！今や抜け忍となった盲目の椎名美里は、かつての仲間から命を狙われていた。黒岩幻斎が率いる暗殺団の一人・水上清四郎は美里を斬ろうとするが、あまりに哀れな姿に一瞬迷いが生じる。その刹那、馬に乗ってやって来た新八が美里の命を救う。同じ頃、新八の妹・お良が「やまびこ」を訪ね、自分を伊賀組に入れてほしいと新八に懇願する。しかし、妹に平凡で幸せな一生を送ってほしいと願う新八が、願いを聞き入れることはなかった。